История о юном герое теперь происходить будет не только на земле, но и на Луне. А если точнее, то на ее темной стороне. Сюжет начинается с 1969 года, когда американцы впервые приземлились на Луну. Там они сделали необычное открытие. Оставшиеся в живых Десептикны предприняли попытку забрать землю у людей. Поэтому они хотят переместить свою планету Кибертрон в земную атмосферу. Правительство Соединенных Штатов Америки тем временем думает о том, как избавиться от Автоботов. Государство еще не осознает, к чему это может привести. Ведь Десептиконы с легкостью смогут захватить планету, если им не будут противостоять Автоботы.