Практически все мутанты погибли. В 2029 году от их многочисленного сообщества осталось два человека. Один из них представляет собой уникальное существо с молниеносной реакцией, невероятными способностями и большим потенциалом, который постепенно утрачивает свою способность к регенерации. Доктор Ксавьер – гениальный интеллект всего человечества, который тоже страдает от стремительной потери своих возможностей. Из-за болезни Альцгеймера он быстро теряет память и уже не может обходиться без помощи главного героя.

Логан работает на старом лимузине водителем и живет в заброшенном бункере. В мечтах у главных героев фильма «Логан» – покупка яхты, на которой те могли бы уплыть далеко в океан, чтобы провести там остаток своей жизни, вдали от большой земли.

Однажды Логан встречает незнакомку Габриэль, после встречи с которой его жизнь навсегда меняется. Ведь теперь у профессора и Росомахи есть Лора – маленький мутант, за которой ведет охоту могущественная корпорация. Злодей Эссекс уже подготовил армию своих воинов для того, чтобы начать наступление и в итоге уничтожить всех мутантов. Лора должна будет сыграть ключевую роль в защите не только своей жизни, но и всего мира.